近五年，学院努力构建科研创新体系，科学研究不断取得新突破，科研综合实力大幅度提高，科研成果数量和质量均取得长足的进步。
在纵向科研方面，国家自然基金获14项经费达到540万元，其中包括国家自然科学基金面上项目1项；承担其他省部级项目12项，纵向课题经费累积1399万元。
在横向科研方面，承担新疆阿拉尔地区荒漠化盐碱化土地生态治理技术应用性研究及效果评估承担等项目课题15项，横向课题经费累积320万元。
在教师发布论著方面，全院教师发表学术论文2063篇，其中SCI、SSCI、A＆HC收录论文23篇，EI收录论文13篇，中文核心期刊论文90余篇。出版专著17部。此外，已授权专利及软著180余项。在科研获奖方面，获全国农业节水科技二等奖1项，国社科一等奖1项，中国水土保持学会优秀设计奖二等奖1项，2020年中国产学研合作创新成果二等奖1项，大禹杯全国农业节水科技二等奖1项，大禹水利科学技术三等奖1项，自治区自然科学优秀学术论文三等奖2项，兵团科技进步一等奖1项，
